Synopsis : À la suite de la dévastation causée par la première déferlante de Godzilla dans Godzilla Minus One, Kôichi Shikishima est déterminé à mener une vie paisible, à reconstruire sa famille avec Noriko et la jeune Akiko, tout en laissant derrière lui les cauchemars de la guerre et des monstres. Mais cette paix est de courte durée lorsque Godzilla revient, totalement régénéré, plus grand et plus féroce que jamais, tandis que quelque chose de très ancien commence à s’éveiller sous Aokigahara, près du mont Fuji, mettant en péril la fragile nation et forçant Kôichi à reconsidérer sa promesse.Alors que les enjeux n’ont jamais été aussi élevés, Kôichi retourne à contrecœur au combat, s’alliant à d’anciens camarades et aux forces de l’alliance nippo-américaine pour affronter les deux kaijus et protéger ceux qu’il aime. D’autant plus que le lien cellulaire de Noriko avec Godzilla se renforce, l’attirant dangereusement vers la rage du monstre.