La montaña sagrada Dans un village des Alpes, Karl surprend un jour sa fiancée Diotima, une magnifique danseuse, dans les bras de son ami Vigo. Jaloux, il entraîne Vigo dans une périlleuse ascension...
Hors-la-loi, El Topo défie pour l'amour d'une femme les Quatre Maîtres du Désert. Les ayant vaincus, sa conscience s'élève jusqu'à ce que sa femme le trahisse. El Topo s'engage alors dans la libération d'une communauté de parias...
Au Mexique, Fenix, un garçon de 12 ans, est le jeune magicien du "Circo del Gringo", dirigé par son père Orgo, le lanceur de couteaux, alcoolique, et coureur de jupons. Concha, sa mère, est trapéziste. Affectueuse mais déboussolée, elle vénère une idole païenne dans l'église de la Santa Sangre. Fénix a pour amis le nain Aladin et Alma, une "petite amie" sourde et muette, qui fait le clown triste et l'équilibriste. Celle-ci a été adoptée et élevée par la Femme Tatouée, qui exhibe ses charmes et montre ses tatouages à qui veut bien les voir - et qui courtise aussi Orgo avec vigueur. Cet équilibre est fragile, et en une nuit, la vie du petit garçon va basculer...
Dans une autobiographie imaginaire et poétique, Jodorowsky nous dévoile son enfance dans les années 30 au Chili. Il décrit précisément les relations difficiles qu’il entretenait avec son père, au sein d’une famille déracinée, qu’il réinvente afin de restituer l’incroyable aventure et quête que fût sa vie.