En découvrant un grand oeuf dans une caverne, Ayana, une jeune écolière, ne sait pas qu'elle va libérer une créature maléfique. Le petit animal, qu'elle baptise Iris, grandit en se nourrissant de la haine que la jeune fille éprouve pour Gamera, un monstre gigantesque qui a causé la mort de ses parents. Mais quand Iris, devenue incontrôlable et énorme, absorbe la jeune fille, c'est une nouvelle menace qui plane sur Tokyo. La ville alors victime d'une nouvelle attaque de Gyaos, va bientôt vivre le pire : une bataille enragée entre Iris et Gamera...
